Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi, Bilim Tarihi Bölümü’nde eğitim alan doktora öğrencilerinden hiçbir eğitim ödeneği talep etmemekte, ayrıca Prof. Dr. Fuat Sezgin İslam Bilim Tarihi Araştırmaları Vakfı tarafından bu öğrencilere burs verilmektedir. Böylelikle öğrencilerin sadece eğitimlerine yoğunlaşmaları hedeflenmiştir.Doktora programına kayıt yaptıracak adaylar, FSMVÜ doktora tam burslu öğrenci kriterleri ve dil puanı, ALES puanı gibi vakıf burs yönetmeliğine uygun şartları sağlamak zorundadırlar.